METABIODIVERSE

METABIODIVERSE é um pipeline de ferramentas bioinformáticas desenvolvido para identificar os organismos presentes numa comunidade a partir de DNA total.

METABIODIVERSE pode ser aplicado a diferentes tipos de dados provenientes de sequenciação de última geração. Foi desenvolvido para contemplar todos os reinos, Eukarya, Archaea e Bacteria, necessitando somente de utilizar as bases de dados curadas para a identificação das regiões de DNA ribossomal em análise (ITS2, D2, V3, V4, V6, ).

O pipeline foi escrito em linguagem python e combina várias aplicações usadas em análise de sequências e em filogenia, permitindo uma análise rápida dos dados.

METABIODIVERSE gera vários relatórios durante o processo de análise, culminando com um relatório final detalhado sobre as espécies identificadas e sua abundância, permitindo estudos de estrutura, composição ou dinâmica de populações.